• 南方网

  • 南方日报

  • 南方都市报

  • 南方杂志

广州 深圳 珠海 汕头 佛山 韶关 河源 梅州 惠州 汕尾 东莞 中山 江门 阳江 湛江 茂名 肇庆 清远 潮州 揭阳 云浮

首个国家基因库昨日在深圳开始运营 市民或可查询自己“基因档案”

2016-09-23 09:09 来源:南方都市报 邹晨辉

深圳大鹏新区金沙路深圳国家基因库数字化平台实验室。南都记者刘有志 摄

  历时5年建设,位于深圳大鹏新区沙片区禾塘仔地块的首个国家基因库昨日开始运营,这是继NCBI(美国国家生物技术信息中心)、DDBJ(日本基因数据库)和E B I(欧洲生物信息研究所)之后,全球第四个建成的国家级基因数据库。也是目前世界最大基因库。南都记者了解到,国家基因库将逐步对公众开放,未来普通市民或可查询到自己独特“基因档案”。

  生物样本存储能力1000万份

  “5年时间过去了,事情终于办成了。”华大基因董事长王建昨日感慨道。2011年,国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、国家卫生和计划生育委员会联合批复,同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库。如今,国家基因库终于落地在深圳大鹏新区观音山脚下,一期占地面积4.75万平方米。据介绍,国家基因库分两期建设,昨日开幕的是一期,目前基因信息数据总量达60PB,生物样本存储能力1000万份。

  昨日在国家基因库一楼展览厅,被“复活”的猛犸映入眼帘。“猛犸象其实是一个消失的物种,5000年前是存在的大型哺乳动物,但它的细胞完整保存,我们可以恢复出胚胎,有合适母体的话就可以重新复活猛犸象。”国家基因库执行主任徐讯说,国家基因库一期目标存储规模是3000万份样本,二期也准备动工,打算在对面山里建隧道用于储存样本,把储存能力提高到3亿。前期做了很多调研,这种方式最有价值。

  在运行机制上,国家基因库成立理事会,由国家发改委、财政部、工信部、卫计委四部委牵头,深圳市政府共同参与,理事会将制定平台建设、运营的规则机制。

  主要功能为“三库两平台”

  国家基因库主要功能是“三库两平台”。其中,三库包括生物信息数据库、生物样本资源库和生物活体库。

  与国外世界级基因库的功能有何不同?国家基因库主任、华大农业集团董事长梅永红说,与美国、欧盟、日本其他三大世界级基因库不同,中国国家基因库不仅仅是数据库,而是国际上现有各类生物样本库、数据库、生物多样性库、疾病库等的综合升级版。除了“干库”(即基因、蛋白、分子、影像等多组学生物信息数据库)、“湿库”(多样性生物样本和物种遗传资源库)外,国家基因库还引入“活库”,即生物活体库,包括动物资源、植物资源、微生物资源、海洋资源等。

  国家基因库中的两平台指的是数字化平台、合成与编辑平台。据介绍,“三库两平台”的建设,最终为的是解决生命数据的“存、读、懂、写、用”。梅永红表示,通俗而言,就是我们要把全球生物资源收集起来,用测序仪读取万物的遗传数据,用超级计算机算出结果,用合成与编辑平台写出生命代码,最后用来为人类服务。

深圳国家基因库展厅内展出的动物标本。

  基因技术与人类生活息息相关

  其实,日常生活已经无形接触到很多基因技术。如罕见病诊断治疗方面,可以从基因数据上实现集中管理、追本溯源。国家正在进行的肠道的精准医疗就是建立在对人和跟人相关外源性生物物种认知的基础上,通过基因测序了解遗传规律、医学范式,此时能否拥有更多基因资源、能否掌握更多遗传规律非常关键。未来,精准医学的发展、竞争某种程度上取决于具有的基因资源及认知基因资源的能力。

  比如,现在我国出生缺陷发生率约为5.6%,怎么预防出生缺陷就是一个大问题,所以做产前检测、孕前监测也是通过基因方法排除。在农业育种方面,基因库也大有作为。比如,袁隆平的超级水稻就是选择合适的基因组进行组合。

  在人类资源方面,基因库主要保存血液样本、组织样本、细胞系、细胞和尿液等,将为重大疾病的前瞻性研究提供样本资源支撑,为疾病诊断与预测及个性化医疗等奠定基础。在动物资源方面,基因库主要保存珍稀动物及具有重要经济价值的动物组织、细胞等。

  焦点

  1 国家基因库更注重数据研发利用

  南都记者了解到,目前国家基因库已存储众多生物资源样本,一些样本由原来分散的储存地点陆续运往基因库,存储总量达1000万份。这些样本具体包括哪些,与目前国际三大基因数据库相比如何,有哪些独特基因数据?

  华大基因董事长王建说,对比美国、欧洲那些基因数据库,他们没有数据,只有样本存储,他们更多的是收集别人数据,我们跟别人交换,希望大家都存进来,这是一个全新模式。据介绍,深圳国家基因库不仅有数字化平台积累别人产生的数据,还可以保存样品等,是一个综合数据库。不仅源源不断产生数据,而且更注重对于数据研发、利用,用于产业发展。未来,国家基因库将依照相关规则开放样本、数据资源,成为一个公共服务平台。

  2 未来公众可到基因库查基因档案

  在昨日发布会上,国家基因库执行主任徐讯说,国家基因库是一个公众平台,有两个共同数据:一是公开的数据,会对各产业机构、公共机构提供相应数据产出服务,产出的数据是谁的数据、谁的样本,就属于谁,但会尽可能鼓励大家贡献出数据,因为共享、共有才能共为。

  国家基因数据库开放共享对普通市民生活有哪些影响?国家基因数据库跟高校、义务制教育有没有可能对接?国家基因库对于普通学生、市民是否开放?梅永红告诉南都记者,这是一个基本要求,最大程度开放、共享是国家基因库基本功能,将来肯定会有很多学生、普通市民走进国家基因库,像查询自己的档案,在国家基因库里面也能查询到自己的基因档案。至于国家基因库对公众具体开放时间表,梅永红表示国家基因库刚启用,肯定有一个准备过程,应该会很快,肯定希望这是一个教育基地、科普基地,也是一个骨髓基地、研发基地。

  3 基因检测今后会成为普惠性技术

  据介绍,国家基因库二期完工后会是一个公共服务平台,逐步对外开放,提供多种公共产品、服务,需要与众多机构联合。该平台也会按照市场机制衍生出一些产品、服务。例如华大基因就有对普通人的收费基因检测业务,类似业务现在越来越多,花900元就可以从一口唾沫里面解读200多项内容,祖源、身体特点、疾病风险甚至天赋。

  至于今后会不会有更有意思的、可以实现的民用基因检测项目,如提高体检精确度但又不需要太多花费?梅永红回应,这个是他们要做的工作,就是不断降低(基因检测)成本,变成一个普惠技术,可能很多人觉得(基因检测)还太远,但随着技术发展,基因检测成为普惠性的技术会大大加快。

  4 选址深圳对广东产业有集群效应

  国家基因库为何选址在深圳?对深圳乃至广东基因、生物、医学等相关产业有什么好处?王建说,国家基因库选址落在深圳的原因有几个:当时第一个国家生物信息中心就依托华大建立,华大2007年由北京搬到深圳,国家发改委不计前嫌,2009年、2010年依然选择华大基因;深圳处在改革开放前沿,它的科技实力、经济实力、前瞻性使得深圳市政府愿意部分承担国家战略发展重任。再说,好山好水好地方当然得建好库。

  梅永红补充道,刚才王建董事长说选人实际上也是选机构,选华大基因,要建立这个库目的不在于建,而在于用,能把宝贵基因资源为全社会所共享共用,才是建库的本质目的。华大基因在许多领域走在前列,如基因组领域已经是世界第一,基因组数据存储能力也是世界领先。作为一个民营企业能以自己能力做这件事情,又有更开放的机制,能打破体制束缚,实现开放共享。

  国家基因库落地深圳对广东相关产业的影响,梅永红认为,国家基因库设在深圳影响有很多,产业有集群概念,一个产业能在一个地方形成,一定是众多资源、众多要素、众多机构汇集的结果,“能在深圳建立一个国家级平台,形成这么多基因资源,可以预见平台能衍生出大量技术、服务。我们一直谈到21世纪是生命科学、生物的世纪,非常需要这样的基础,有这样要素积聚的特定环境,华大基因运营国家基因库对深圳的价值就是在这。”(采写:南都见习记者 邹晨辉)

编辑:陈冰青
回到首页 回到顶部

南方报业传媒集团简介- 网站简介- 广告服务- 招标投标- 物资采购- 联系我们- 法律声明- 友情链接

本网站由南方新闻网版权所有,未经授权禁止复制或建立镜像 广东南方网络信息科技有限公司负责制作维护

违法和不良信息举报电话:020-87373397 18122015029 18122015068

ICP备案号:粤B-20050235